ライブペイントでのレイヤー分け

イラレのライブペイントを使えばパスが閉じてなくても簡単に色を塗りつぶせるのが楽で良いんだけど、ライブペイントのために線画全体をグループ化してしまうと、せっかくイラストのパーツ毎にレイヤー分けしたのが無意味になってしまう。グループ化された状態でもダイレクト選択ツールでパーツ毎にプロパティは変更できるけど、根本的な解決になっていない。こうなると、もともと線画の段階でパスを閉じて制作しろという話に逆戻りなわけで、なんとかいい方法はないか模索中。